Этот ньюанс есть, когда у человека есть паралельно Шенген и ВНЖ. Полиция же считает по следуещему. При въезде-выезде вам ставили штампы. На них они и опираются, при подсчете дней. По какому разрешительному документу вы заезжали-выезжали, они выяснить не могут. Поэтому, даже если вы находились в Шенгене по ВНЖ, дни визы вам считают. Если у вас закончится ВНЖ и вы захотите въехать в Европу по визе, а дни коридора вы исчерпали, вам откажут во въезде.
Ситуацию знаю точно, сам был в такой, консультировался со старшим смены на границе