Ничто ничему не противоречит. В п.А идет речь об основной секции светофора, а в п.З - о дополнительной.
Исходя из предыдущего запрета, следует, что это является нарушением и трактуется как проезд перекрестка на запрещающий сигнал светофора. У нас в Одессе раньше постоянно отлавливали работники ГАИ на определенных перекрестках. Кроме того, если двигаться при не горящей дополнительной секции налево, то произойдет пересечение со встречным потоком, который движется на свой разрешающий сигнал светофора. Так что все здесь правильно. Насколько я знаю, в Европе можно двигаться на не горящую стрелку дополнительной секции только направо. В этом случае она работает как стрелка на табличке.