Информация во внеске должна подтверждаться документами, которые к нему прикладываются.
Если в СоР у Вас есть девичья фамилия матери, а в СоБ нет, то, во-первых, непонятно какой из документов правильный, а какой нет (то есть, один документ подтверждает данные во внеске, а второй - опровергает их), а во-вторых, документы могут относиться к разным людям, у которых похожие персональные данные, отличающиеся только наличием (или отсутствием) девичьей фамилии матери.
ЗЫ. Отдельный квест - это когда в реестре актов данные меняют, а в реестре PESEL - нет. У меня, например, фамилию при рождении забыли вписать, а у жены - имя матери после внесения исправлений в акт.
Впрочем, это решается при подаче на довуд - ужонд при оформлении внеска сам отправляет запрос на изменение данных.