Да не за что) У вас такая сложная, на мой взгляд, ситауция, очень хочется чем-то помочь, но даже не знаю чем   
Ясно одно, что если он уже нарушил сроки нахождения по визе, по которой въехал, то это скажется на его дальнейшей визовой истории. И если ему сейчас уехать в Украину, то чтобы вернуться обратно, ему нужно будет получать визу, а боюсь, что ему в ней откажут... 
 
Ситуация можно сказать стандартная!Утеря паспорта и делов то!(получаете в посольстве произдной документ и едете домой без депортации!!!))
 
  
  
То есть,запрос остается в силе,и он сможет ждать дома,пока сделаются те документы? 
  
 
 
  
Да не за что) У вас такая сложная, на мой взгляд, ситауция, очень хочется чем-то помочь, но даже не знаю чем   
Ясно одно, что если он уже нарушил сроки нахождения по визе, по которой въехал, то это скажется на его дальнейшей визовой истории. И если ему сейчас уехать в Украину, то чтобы вернуться обратно, ему нужно будет получать визу, а боюсь, что ему в ней откажут... 
 
  
  
Ясно одно тогда,что лучший вариант-дажодаться и все)